痢疾杆菌是革兰阴性菌,故选用的抗生素大多是三代头孢类、加酶的青霉素类药物。头孢曲松:本品为第三代头孢菌素类抗生素,对肠杆菌类细菌有强大作用。静脉注射给药,按体重一日50-80毫克/千克,连续5-7天。因肌注疼痛且不易吸收故应避免肌内注射。头孢曲松不能加入林格等含有钙的溶液中。有黄疸的新生儿或有黄疸严重倾向的新生儿应慎用或避免使用。 
头孢他啶:是杀菌性头孢菌素类抗生素,可耐受大多数的-内酰胺酶,适应于对广谱的革兰阳性及革兰阴性细菌感染的婴儿及儿童:对于2个月以上的儿童,一般的剂量范围是每天每公斤30-100毫克,分2或3次给药,共5-7天。新生儿至两个月大的婴儿,一般剂量每天每公斤25-60毫克,分两次给药。其不良反应有局部因静脉给药引起的动静脉炎或血栓性静脉炎;肌内注射后疼痛和/或发炎。过敏反应与其他头孢菌素一样。需注意头孢他啶在碳酸氣钠注射液内的稳定性较次于其他的静脉注射液,所以并不推荐用此注射液作稀释液。头孢他啶与氨基糖苷类抗生素不应在同一给药系统或针筒内混合。曾经有报道,当万古霉素加入已制成的头孢他啶注射液后,会出现沉淀。因此在先后给予两种药物的过程中,必须谨慎冲洗给药系统和静脉系统。 
头孢克肟:本品为第三代口服头孢菌素,抗菌谱广,混悬液口服吸收较胶囊好,肾功能不良者应减量应用,新生儿、早产儿慎用。用法3-5毫克/千克•天,连续5-7天。有休克史者禁用。家族对) β--内酰胺类有过敏史者应慎用。